自分は最新のFlashを使いたいのでいつも本家からダウンロードしてきてそれを実行して
Flashのインストールをしています。

install_flash_player_9_linux.tar.gzを適当な所へ解凍して、端末からその中のflashplayer-installer
を実行すると質問してきます。

お勧めはそれを実行する時にrootじゃなくて普通の権限でやる。すると自動的に
/自分のホーム/.mozilla　が選ばれてくるからそのままエンター。
最後にその他の場所へインストールをしますか?って聞いてくるからnを選んで終了。
これで/自分のホーム/.mozilla/plugins/libflashplayer.soがインストールされ使用できる。
このディレクトリへインスコしておけば、Ubuntu再インストール時に/homeをそのままにしておく
方法ならFlashの最インスコが必要なくなるから便利。

注意点としてはインストール実行前に/自分のホーム/.mozilla/pluginsと/usr/lib/firefox/plugins
と念のため/usr/lib/mozilla/pluginsの中にlibflashplayer.soとflashplayer.xptが無いか確認
したほうが良いよ。有ればそれを削除してからのほうがいい。