Cygwin端末(mintty)を開く
→「cd 」と打つ (最後の半角スペースまで含む)
→エクスプローラから、minttyへフォルダをドラッグ&ドロップ
→minttyをアクティブにして、Enterキー

…で、ディレクトリ行けなかったっけ？