> 全ての下位パッケージとバージョン番号まで記録されているため、下位パッケージの
> どれか一つだけ更新した場合でも依存関係が壊れる。

壊れねーよ。portupgrade なりで警告出るだけだ。

> パッケージの最新追っかけをしたい場合、ビルド地獄が待ち受けている。

package ならインストールするだけ。ports なら最新にしたいなら当たり前だろ。