俺も23.1.90試してみたけど
あまりにも動作が重くなって(特にバッファの切り替え)
23.0.96に戻した。

.fonts.confとかいじればなんとかなるのかな？

ちなみに、うちの環境
OS: Mac OSX 10.5.8
X: XQuartz 2.4.0
gtk2: 2.18.2

Cocoa版とかCarbon版じゃなくてX11版をコンパイルして使ってます