Unicode では ＼ は U+5C、￥ は U+A5 と別のコードがあります。

Emacs22 組込みの UTF-8 だと、以下の設定で ￥ を ＼ にデコードできるかも。
(puthash #x00a5 ?\\ ucs-unicode-to-mule-cjk)