portsnapは(気にならないわけじゃないけど)別にかまわんだろう
自動でやったからといって実行ファイルが書き換わって知らない
うちに動作が変わるわけじゃないから

自分一人で使ってるならともかく仕事等で使っているサーバなら
知らないうちに動作が変わるなんて管理上許容できない場合が
多いしカーネルの修正はリブートが必要だし、ライブラリの
習性の場合は影響範囲を検討した上で何をするか決めなきゃ
いけないんじゃないの?

そんなの言わずもがなかも知らんけど