両方じゃね?俺も正しく入力(表示が化けてw)できないので
Koffice使ってる。。。が解決じゃないのでショボーン。

因みに俺の場合 (anthy+uim)
入力時(一文字づつ)
あ→?¢
い→??
う→?U
え→?¨
お→??

入力完了後
あ→¢?¢
い→???
う→U?U
え→¨?¨
お→???

さらに、文字列になると激しく文字化けが増殖していく。。。
もじれつ→??????t????r??j?????????
あいうえお→U?¨???U?¨??U??¢?¢???U?¨??

フォントがダメなのかといろいろいれて、UTFじゃダメなのか、
EUCかShiftJISなのかとやったけどどれもそれぞれで文字化け
(上はShiftJISで入力している例。)うわぁぁぁん(AA略