「使っている」レベルなら，世界最速のBlueGene/Lからして入出力はLinuxではある。
http://www-06.ibm.com/jp/solutions/deepcomputing/solutions/bluegene.shtml

この手の計算機だとインターコネクトのレイテンシは結構計算能力に効くので
MyrinetやInfinibandを使いたいという意味でFreeBSDではなくLinuxを使うというのはわかる。

しかし，インターコネクトにGbE/10GbEを使っているのに*BSDではなくLinuxを採用している
システムばかりというのは，何か理由があるのではないか，と思った次第。
＃この手のシステムだとOSも性能が出るようチューンするはずなので
＃何使ってもいいのではないかと言われればそうかもしれない。