っつかさー、X不要ってんだったら
設定はほとんどテキストエディタだし、あとはデーモンの再起動だけだよな
このへんってFreeBSDもLinuxもそんなに変わらないだろ？
ディレクトリ構成にやや方言はあるかもしれないけど

大きな違いがあるとしたらパッケージシステムくらい？
これもコマンドの使い方おぼえればどれも似たようなもんだと思うけどなぁ

書店でサーバー構築入門の本読んで
内容的に気に入ったのから始めるかたちでいいんじゃないの？