FreeBSDの利点、とかいわれてもなぁ・・・
俺パーソナルユースだし、常にFreeBSD、Linux両方使ってる訳じゃないし。

欠点はといわれれば、インストーラーの不親切かなぁ。
あれはさすがに直した方がいいと思う。俺は直せないがw

後、日本語環境とかXがデフォルトってのは欠点にもなるからねぇ。
使わない場合後で消さなきゃいけないでしょ。