軽く切り分け作業をしてみたんですが、なんかlibiconv単体の問題じゃなさそうです
ね。同じREADME_j.txtでも1,200を保存しようとすると×で、1,100や101,200とわけ
れば○。ちなみにiconv -f cp932 -t euc-jp README_j.txtは問題なく通ってますね。

6.4になってから混入した問題か、libiconv 1.10との組み合わせの問題か、最近の
パッチで修正された部分に該当するかは不明です。