:.!cat
のようにしてフィルタを呼び出した時に文字化けしてしまうことがあるのですが
フィルタとのやりとりに使うencodingの指定、もしくは
フィルタとのやりとりは素通しする設定はできないでしょうか？

euc-jpでひらがなやカタカナだけの文字列を渡すと再現しやすいようです。
fencsからcp932を外せばとりあえずは収まりますが...