消したものを取り戻すのは不可能。運がよくて大金か凄い技術があれば
ハードディスクを直接さらって復元できるかもしれないが、まあ訊きたいのは
そんなことではないのだろう。

インストール直後の状態に戻すというのであれば、
make buildworld / make installworld するとか、
インストール用のbin.??を展開してそのvarだけ持ってくるとかすればいい。
質問内容から知識レベルを推すに、後者がいいだろうな。
/var/db/pkg の中身は諦めろ。