automake とかに詳しい人に質問です。

navi2ch-be2ch.el を作って、それを Makefile.in と bcomp.el に反映する為に
Makefile.am の lisp_LISP に追加して、
aclocal && autoconf && automake
をしました。

んで、configure && make すると、
Makefile:660: warning: overriding commands for target `navi2ch-version.elc'
Makefile:234: warning: ignoring old commands for target `navi2ch-version.elc'
こんなかんじの warning がいっぱいでるようになっちゃいました。

なんででしょうか？
生成された Makefile をみても何がなんだかさっぱりです (´･ω･`)

環境は以下です。
CYGWIN_NT-5.1 XXXX 1.5.12(0.116/4/2) 2004-11-10 08:34 i686 unknown unknown Cygwin
aclocal (GNU automake) 1.9.2
autoconf (GNU Autoconf) 2.59
automake (GNU automake) 1.9.2

>>34
やっときます。