portsとは別にpkgで古いバージョンのものをインストール
してたりしない?
>>831の場合だと pkg_delete -f expat-1.95.4)
してからもう一回だけど。

色々出てきて面倒だったら
# setenv FORCE_PKG_REGISTER yes (csh系の場合)
してもう一回だね。ほかの問題が出てくる可能性はあるけど