>>957
sbin/portupgradeを読めばわかりますが
-aが指定されていると-rと-Rは無視されます。
-r/-Rは「コマンドラインに指定したportについて依存関係にあるものを調べ、
それらがコマンドラインに指定されたように処理する」というオプションです。
-aは「インストールされているものすべてをコマンドラインに以下同文」です。
どちらにせよ、依存関係の根っこにあるものから処理していきます。

少なくとも今では。

>>960
こんな感じで。
ttp://home.jp.FreeBSD.ORG/cgi-bin/showmail/FreeBSD-users-jp/67879