*howmS*バッファには、
hoge.tex |
2004-11-05-120415.howm | >>>~/hoge.tex

*howmC*バッファには、
==========================>>> ~/hoge.tex
%%% tex-mode %%%

と出ます。(この%%% tex-mode %%%って何でしょうか。)上の方のバッファで
hoge.texでEnterを押すと、*Message*は、こうなります。
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（省略）
Welcome to the field of YaTeX. I'm glad to see you!
Loading tex-mode...done
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つまり、yatex-modeがまずloadされ、tex-modeで置き換わっているようです。
何かご助言いただけましたら幸いです。