ローマ字入力でも始めてから数年は
頭の中で読みからアルファベットへの変換を思いうかべてから入力してました。
数年かかって、文字を読んだら意識しないで指が動いている、
というレベルになったので、
漢直でも頭の中で打鍵を意識しないで打てるようになるには
数年かかるかなぁと思ってたりします。

また、かな漢字変換から漢直に移行してから、辞書をひくことが多くなりました。
どういう文字だっけと思いつつ、集収? 不可決? とか入力してしまったりするので。
文字づかいに自信がなかったら辞書をひくようになりました。
広辞苑第五版(EPWING)をディスクに入れて使ってます。