説明がわかりにくくてすみません。

C-x 2 した後など、window が複数ある時に、
マウスカーソルのすぐ下にある
buffer をスクロールさせたいということでした。

自分で調べたらすぐにやり方わかりました。さらにすみません。
(setq mouse-wheel-follow-mouse t)
これでできました。