通常のフォルダは先頭のままで .files のフォルダは名前順で表示できませんか？
イメージは下の感じです

111(フォルダ)
111.files(フォルダ)
222(フォルダ)
222.files(フォルダ)
333(フォルダ)
111.htm
111.txt
222.txt
222.htm

↓

111(フォルダ)
222(フォルダ)
333(フォルダ)
111.files(フォルダ)
111.htm
111.txt
222.files(フォルダ)
222.htm
222.txt