■PCSX2 0.9.8 (r4600)　本家正式版
ttp://www.pcsx2.net/downloads.php

■SVN版の最新ビルド入手先 （スレ立て時の最新リビジョンはr5338）
ttp://buildbot.orphis.net/pcsx2/　(公式ビルド)
ttp://www.emucr.com/search/label/PS2/　(非公式ビルド)

■変更履歴
ttp://code.google.com/p/pcsx2/source/list

基本的にはSVN版の使用を勧めます。
正式版の0.9.8 (r4600)よりも互換性、機能性、速度が向上しているからです。
しかしSVN版は実験的であるので、リビジョンが上がると何かしらの不具合が出る事もよくあります。
何か不具合があった場合は正式版も試してみましょう。