汚染物質の種類にもよるだろうな。
エタノール精製過程で除去できるもの、燃えて無害になるもの、
燃えて別の有害物質になるもの、燃えないもの。
前の2つなら無問題。

それより、汚染農地ってそんなにあるの？
それに汚染されているなら農作物は育たないんじゃないの？