再起動してみましたが、やっぱり症状変わらずです。

MYSQL単体だとログインが出来て、テーブルも作れます。
PHP5もphpinfo()で動作は確認しています。

やっぱり、接続中に何らかしらのトラブルが発生しているようです。
ネットワーク周りとかで、疑った方がいい設定値などありますか?