ファイル転送に使ったソフトは何ですか？
無料の相乗りサーバのようなのでファイルの
転送が不安定なのかも知れませんね。
webapp/modules の中身がうまくアップロード
出来ていないのかなぁ。

一旦、webappディレクトリを削除して
みんなが寝静まる深夜に転送し直す。
mysqlのデータベースの内容を全て削除。
インストール作業を最初からやり直す。

こんな流れでどう？