window.open(url,"HOGEHOGE")
で開いたウィンドウを"HOGEHOGE"という名前を頼りに
ウィンドウが存在するか確認する方法はありますでしょうか？

window.openで返ってくるOBJECTを変数に入れるというのも考えたのですが
元ウィンドウが別のページに移ったらわからなくなるので・・・。