>>123
そもそも、そのアプリ全然知らないんだけど…

まずLinuxなので普通socketが接続に使われるんですが
その辺Port使うようになってます/してます?
その他設定がどうなってるかこっちでは判らないのですが、
PlogではMySQLの接続を最終的にadodb-mysql.inc.php内で
mysql_connect/pconnect関数の第1引数として渡しているだけみたいなので
ソケット接続の場合はホスト名のところを
'localhost:/tmp/mysql.sock' (デフォルトのままのソケットファイルの時)
ポート接続の場合は、'localhost:3306' のように強制的に指定してみてください。
3306とポート番号だけ書くのは、3306という名のホストを指定してることになります。