"Perl文字列"の内部の実装がUTF8だとしても、そのことを意識する必要はない。
UTF8フラグという名前が良くないが、これはPerl文字列フラグと読み替えればいい。
Perl文字列フラグがついていればPerl文字列（繰り返すが中身がUTF8なのは知らなくていい）

http://perldoc.jp/docs/perl/5.10.0/perlunifaq.pod
> 内部表現は何か分からないエンコーディングで、常に明示的にエンコードと
> デコードが必要ということにしておいた方がよいです。


だからPerl文字列フラグ付きのUTF8やLatin-1などというものはない。
Perl文字列フラグがついていれば、それはすべて同じPerl文字列。


あとは自分のプログラムは文字列を扱うとき、"Perl文字列"を基本として使うのか（統一された文字のモダンなやり方）
"バイナリ"を基本として使うのか（互換性重視の古いやり方）を決める。"Perl文字列"なら文字と1文字として扱える。
"バイナリ"だとそうはいかない。

Perl文字列を基本として使うなら、Perl外部のネットワーク、ファイルの読み書き時にすぐに変換して
Perl文字列メインでコードを書くことになる。

もし古いモジュールがPerl文字列対応になっていなければ、バイナリに変換して呼び出すラッパーを書くことになるだろう。


反対にバイナリを基本として使うのなら、バイト数ではなく文字数を知りたい時など、
文字として扱いたいところでPerl文字列に変換して関数を呼び出す。
そういうラッパーを書くことになるだろう。


どちらを基本にするかをしっかりと自覚しているのなら、あとはラッパーが変換し、関数を呼び出し、ラッパーがもとに戻す。
ラッパーが違いを吸収して、Perl文字列だろうがバイナリだろうが、自分で決めた基本に統一できるのだから状態を確認する手間はない。