RewriteEngine On
RewriteRule .* index.php
まずこうしてmod_rewrite、文法どちらに問題があるのか切り分けてみなよ。

文法が間違ってるなら
RewriteLog /var/log/httpd/rewrite_log
RewriteLogLevel 9
としてログを見ながら原因を探る

RewriteCond %{DOCUMENT_ROOT}/%{REQUEST_FILENAME} !-f
でいけるかもしれない。