PCからのノイズやジッタを考慮して比較すると個人的には
パルストランス同軸=アイソレートUSB>光>同軸>>>USB

例えばPMA-50ならUSBでもノイズは断ち切られてる(はず)
ただそれなり以上のシステムや耳性能がないと同軸以上の差の聴き分けは難しい