本当にkona 3.0?
というのは
kona 2.3では最近のアップデートでフォント設定が変わってしまう問題が出てる
直し方は
sudo cp /usr/share/fontconfig/conf.avail/* /etc/fonts/conf.avail

一般にフォントはdebianはubuntuに比べると汚い
klueなら綺麗かも？