理研のftpサーバからdagのhoge.src.rpm落としてきて
rpm -ivh hoge.src.rpm しても
MD5チェックサムが適合しません、とエラーが出ます。
強引に進めるのは気持ち悪いのですが、
上記エラーの理由はなんでしょうか？

rpm --checksig hoge.src.rpm
では md5 OK となります。