http://mobilehackerz.jp/archive/archos/

にある、
「ローマ字Renamer! (JapaneseRenamer.zip)」
http://mobilehackerz.jp/archive/archos/japaneserenamer.zip

みたいに日本語ファイル名を一括でアルファベットに変換できるアプリまたは
比較的簡易な方法はあるでしょうか？

可能ならばCUIでできると嬉しいのですが・・・。

ackというのは見つけたのですが、これは文字コードコンバータでこれはこれで
利用する場面はありそうです。