>>172
>最後に開いたマップ等のデータも記録されている

↑のデータを記録しているのはたぶんRPG_RT.lmtだね。
このファイルが一個ぐらい重複してパッチに含まれるぐらいなら誤差レベルだと思うんだけど…。
それより下手に手動でやって>>63みたいなファイルの歯抜けが発生するほうがマズいと思うんだけど。
どうしても気になるならRPG_RT.lmtのハッシュを生成するときに "最後に開いたマップ等のデータ" の部分だけ
読み飛ばしてハッシュを生成して新旧のファイルの比較をすればいいと思う。

参考リンク
RPGツクール2000/2003/XP 解析データまとめページ - RPGツクール2000/マップツリー
ttp://rpg2kdev.sue445.net/?RPG2000%2F%A5%DE%A5%C3%A5%D7%A5%C4%A5%EA%A1%BC