ボスの死亡タスクに攻撃（フラッシュ）を入れておく
（消したいキャラにはフラッシュに反応する設定しておくこと）

これが一番簡単かな

システム変数の一つを自機無敵オンオフ用に使い
0だと通常、1だと無敵になるように自機スクリプトを設定しておくのも手だね
クリア演出に入るときに1にして出動の時に0に書き換えればいい