＞サイズの大きい音ほどそういう傾向があるようです。

　サイズ大きいかはよくわかりませんが大きくて約１１KBくらいです
　データ小さくするようなツールとかあります？

＞そういう音はアプリの音量を0にした上で予め別のフレーム(もしくは同じフレーム)で1回鳴らしておくのはどうでしょうか。

　効果音が鳴るたびにFPSが１減ってるみたいです
　データ大きいのかな…