セーブイベントはツクールの仕様上扱いが難しいのです。
詳しくはver 0.082cのchangelogに書いてあります。
解決案を3つ考えました。どうでしょう？

・リレー走者は必ず内部データを変更する事を義務付ける。
　やること→リレーの際はコモン0032の最初の命令にある、変数0011を変更する。
　　メリット→今のイベントを変えなくて済む。表現の幅が広がる。
　　デメリット→初心者には良くわからない、そもそも知らなかった、もしくはうっかり忘れる可能性がかなり高い。きっと忘れる。

・セーブイベントをシンプルに変える
　やること→セーブ画面の呼び出しの後にイベントが続くのは鬼門なので、MAPイベントを「セーブ画面の呼び出し」のみに変更する。
　　メリット→確実にバグが回避できる。
　　デメリット→表現の幅が狭まる。

・リードミーに旧データの引継ぎは出来ない事を強調する。旧データによるバグは一切サポートしない。
　※今もおまけで出来る様なもんだしね。
　　メリット→製作者の気が楽ｗ
　　デメリット→プレイヤーが最初から取り直すハメになる。