>>651
普通にレイヤー編集が出来るマップエディタでだいじょうぶでしょ
マップチップをモンスターやらイベントやらに割り当てればいい

地形レイヤー（あれば便利な当たり判定レイヤーを分けるといい）
イベント配置レイヤー（アイテム・モンスターレイヤーで分けてもいい）

好きなだけ必要なレイヤー作ればいいと思うよ