サンプルのタイトルの前のシナリオで立ち絵表示させたら隠れたけど。
選択肢の背景画像に立ち絵のプライオリティを入力すれば解消できた。
(初期値だと『背景』になっているけど、これを『キャラ手前』などに変えると立ち絵の上に表示できる)