さんきゅ
JOGLなんて久しく触れてなかったから忘れてたよ

結果からいうとTransparentのチェックいれるとCPUパワー使い切って描画サイズ大きくすると
35fps前後まで下がるけど、これはずすとサイズに関係なく40fpsでCPU使用率は低い

自動リフレッシュはMAXが40fpsなのかな
ウインドウを動かすとfpsが上がって滑らかになるところを考えるとたぶん余力はある・・・のか
描画をすべておぺｎGLでやってる場合はアクセラレーションがきいていると考えてよさそうだ

ソース読んでないけど