よく見るとプリミティブエンジンは頂点シェーダーの後に配置されていますね。
ということは、従来通り同次空間でのクリッピングになるのでしょうね。
まあ確かに複数マトリクスのブレンドなどを考えるとローカル空間でのクリッピングは無理があるのですが。