相変わらず出来ないのですが、やったことを報告します。

rip出来なかった番組Aをそのままにして、全く別の番組Bを2分ほどを追記。
Unit_Kye_RW.infのLBA値は変化なし。
BackupBDAVでripを試みるも、
当初からripできない00001.m2tsに関しては相変わらず
「Hhm... maybe Binding Nonce is wrong!」というエラーメッセージ。
一方、追記した00002.m2tsに関してはrip成功。
このファイルについては通常通りに扱えます。

次に、番組Bを1つ目の番組（00001.m2ts）として、
問題の番組Aを2つ目の番組(00002.m2ts)としてレコにてBD-REにダビング。
Unit_Kye_RW.infのLBA値は変化しました。
しかし、BackupBDAVでのripは失敗。エラーメッセージはこれまでと同じでした。

メディアの不良も考え、2枚のメディアでやりましたが結果は同じでした。
メディア不良でもなく、焼きミスでもないですね。
レコ内のtsファイル自体がCMカットによる編集のせいなのか、
rip出来ない構造になってしまっているようです。
どうしたものでしょうか・・・。