:set path?
で現在のディレクトリを確認したあと

:set path-=hoge
で要らないディレクトリを削除

:set verbose path?
で自動でセットしてる犯人特定

設定書くならこいいうの

augroup vimrc
autocmd!
autocmd FileType cpp setlocal path=.,/usr/include,/usr/local/include,/foo/bar
augroup END