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[0195 名無しさん＠お腹いっぱい。 2015/05/15(金) 14:16:18.80]

>>193-194
ということはfiletype plugin indent onより前のautocmdは無意味なのか検証してみました

autocmd FileType php setlocal tabstop=1 shiftwidth=1 softtabstop=1
autocmd FileType php set commentstring=#\ %s
filetype plugin indent on

インデントは1になりましたがcommentstringだけは上書きされません