\rを全部消して実行してみました。
# bash -x secrets.sh
secrets.sh: line 2: syntax error near unexpected token `do'
secrets.sh: line 2: `do bin2xml $x.folder/AndroidManifest.xml
> $x.folder/AndroidManifest.decoded.xmldonefor x in `find . -name "AndroidManifest.decoded.xml"`do
echo "$x:" >> output.txt cat $x | grep -i host | sed 's/android:host=\"/*#*#/' | sed 's/\" \/>/#*#*/' | sed 's/\t\t\t\t\t//' >> output.txtdone'