これまでにファイルシステムの層で、ddを使って比較しています。ファイルシステムより下の層は、dmesg等で確認しただけです。ハードウェアは同一のものです。(hddも含めて同一機材で、各種osをクリーンインストールし直して実験してます)

NetBSD6stable udma6 ffs2 85MB/s
ubuntu12.04.3 ext4 140MB/s
FreeBSD 9 udma6 ffs 130MB/s
(いずれもwrite。readもほぼおなじ傾向を示します)