カーネルレベルで互換性ないのは普通だろ。x86除くとその方が普通。
ユーザーレベルのプログラムはきっちり互換。というか、そうでないと
バイナリを共有できんだろ?

% echo 'dir' | ftp ftp.netbsd.org:/pub/pkgsrc/packages/NetBSD/ | grep mips
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 algor -> mipsel
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 arc -> mipsel
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 cobalt -> mipsel
lrwxrwxr-x 1 1162 netbsd 6 Sep 18 2008 ews4800mips -> mipseb
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 hpcmips -> mipsel
lrwxrwxr-x 1 1162 netbsd 6 Sep 18 2008 mipsco -> mipseb
drwxrwxr-x 8 1349 netbsd 512 Nov 4 2010 mipseb
drwxrwxr-x 9 1349 netbsd 512 Nov 14 01:53 mipsel
lrwxrwxr-x 1 1162 netbsd 6 Sep 18 2008 newsmips -> mipseb
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 playstation2 -> mipsel
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 pmax -> mipsel
lrwxr-xr-x 1 1349 netbsd 6 Jul 24 2007 sbmips -> mipsel
lrwxrwxr-x 1 1162 netbsd 6 Sep 18 2008 sgimips -> mipseb

遅延スロットなら、ユーザーランドだよな?