データ解析ツールoctaveを語ろう Part 2

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2009/10/28(水) 22:13:01

知る人ぞ知る強力なデータ解析ツール octave ...

unixを科学研究で使っている香具師には非常に心強い味方のはずだ。

matlab互換を主張しながら、微妙にバージョンアップを続ける
octaveについて語ろう。

そのPart 2です

前スレ

データ解析ツールoctaveを語ろう
http://pc12.2ch.net/test/read.cgi/unix/1086016412/

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2010/11/24(水) 09:50:17

>>73
>GotoBLAS2 has been released by the Texas Advanced Computing Center
>as open source software under the BSD license.
素晴らしい。
従来は独特のライセンスのせいでユーザが自分で組み込む必要がありましたが、
今後は公開ソフトウェアに最初から組み込めるわけですね。

GotoBLAS2-1.13で打ち止めへ　(2010-04-09 13:29:50)
http://blog.goo.ne.jp/nakatamaho/e/61d0cfbe1222364a3ef70505dce4f463
後藤和茂さんがヘッドハントされてからバージョンアップが止まってますが、
これも改善するかもしれません。

**octave for windows メモの筆者** · 2010/11/24(水) 19:04:09

>>73
Goto BLASの開発は，終了したようです。
http://blog.goo.ne.jp/nakatamaho/e/61d0cfbe1222364a3ef70505dce4f463

残念ですが。

**octave for windows メモの筆者** · 2010/11/24(水) 19:06:02

>>75 すみません。
74をみていませんでした<m(__)m>。

**octave for windows メモの筆者** · 2010/11/25(木) 14:49:21

>>74
>後藤和茂さんがヘッドハントされてからバージョンアップが止まってますが、
>これも改善するかもしれません。

そうですね。
天才ハッカー（いい意味でのハッカーです。）後藤さんのあとを
続くような方が現れてプロジェクトとして
立ち上がってくれればいいのですが。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2010/12/21(火) 14:14:37

scilabとの違いが良くわからない

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2010/12/21(火) 15:21:18

>>78
Scilabの使いにくい点
・実行
　MATLAB/Octaveは、拡張子.mを省いたmファイルをコマンドラインで打ち込めばいい
　Scilabは、コマンドラインでexec('hoge.sce')とやらないといけない
・関数定義
　MATLAB/Octaveは、パスの通ってるディレクトリかカレントディレクトリにあれば
　　勝手に読み込んでくれる。
　Scilabは、明示的にgetf('hoge.sci')と読み込まないといけない。
　※Scilab5では途中からgetfではなくexec('hoge.sci')になった
・コメント行
　MATLABは%、Octaveは%と#
　Scilabは//
・その他、ScilbはMATLABから見て方言が多いし、Octave Forgeのような豊富な関数を使えない。

利点
・グラフがOctaveよりはきれい
・Serial-0.2.tgzという非オフィシャルのパッケージを導入すると
　RS-232Cのコントロールが可能
例えば、COM3のモデムを操作する場合

fp=openserial(3,"9600,n,8,1")
writeserial(fp,'ATI0'+ascii(13))
xpause(200000)
readserial(fp)
xpause(200000)
writeserial(fp,'ATI1'+ascii(13))
xpause(200000)
readserial(fp)
closeserial(fp)

こんな感じ。xpauseはパラメータのμ秒数だけ待つ命令

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2010/12/22(水) 13:33:15

データを全部テキストデータで保存すると
ファイル増えてしかたない
sqliteあたりにまとめて保存できないでしょうか

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2010/12/23(木) 22:20:35

>>80
saveコマンドがあります

aaa=[1:1000];
save hoge.sav aaa

とやれば変数aaaがhoge.savにテキスト形式で保存されます
読み出す場合は

bbb=load('hoge.sav')

とやればいいです
この場合テキスト形式ですけど

save -binary hoge.bin aaa

とやればバイナリーで保存できますが、テキストよりもサイズが小さくなるかどうかはケースバイケースです
読み出しは

ccc=load('hoge.bin')

とやれば、勝手に保存形式を判断してくれます。
またMATLABのsaveコマンドで作られたファイルとの互換性もあるようです

**octave for windows メモの筆者** · 2010/12/24(金) 17:39:00

>>79
・グラフがOctaveよりはきれい
Ver. 3.3.54+ のFLTK Backendは,グラッフィクス，かなりよいですよ。
でも，自分でビルドしないと使えないのとMinGWではまだバグがある。

Ver 3.4はどれくらいかかるかな。
JWEさんのエンジンかかってきたから，数ヶ月後にはでるとおもうのですが。

**octave for windows メモの筆者** · 2010/12/30(木) 05:32:50

>>80
help save

`-zip', `-z'とか`-hdf5'を使うと小さくなると思うのですが。

**octave for windows メモの筆者** · 2010/12/31(金) 06:32:59

東京電機大学の松田先生の「Octaveの精義」がでました。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/01/02(日) 08:27:31

ttp://www.amazon.co.jp/dp/4877832319/

**octave for windows メモの筆者** · 2011/01/19(水) 18:39:37

開発版も様々なプラットフォームでのビルドがかなり安定してきています。
私は，MinGWのビルドしていますが状況はかなり改善しています。

3.4リリースが確実に近づいています。
新しい fltk Backend は,すばらしいものです。
できるだけ早く皆様が見る日がくればいいなと思います。
Debianなどでは，自力でビルドできる方がいらっしゃると思います。
ビルドできる環境におられるかたは
是非自力で開発版をビルドされて，
その実力をみていただきたいと思います。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/01/24(月) 07:26:47

Octave 3.4のリリースの準備としてOctave 3.3.90がリリース（ソースのみ）
されました。

http://alpha.gnu.org/gnu/octave/

多くの方にビルドいただき，3.4のリリースにご協力いただきたいと思います。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/01/28(金) 08:30:06

Octave 3.3.90のMinGWでのビルドを行ってバイナリパッケージを作成してみました。 http://www.tatsuromatsuoka.com/octave/Eng/Win/

**octave for windows メモの筆者** · 2011/02/02(水) 09:18:42

Octave 3.3.91のMinGWでのビルドを行ってバイナリパッケージを作成してみました。
http://www.tatsuromatsuoka.com/octave/Eng/Win/
いくつかのバグがフィックスされています。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/02/08(火) 08:12:40

>>89
テストパッケージ、ありがたく使わせてもらっています。

octaveと直接関係ないところで申し訳ありませんが。。。
パッケージに入っているckwなのですが、ckw.cfgの以下行が

Ckw*chdir: d:\usr\Tatsu

自分の環境に存在しないディレクトリだとckwが
立ち上がらないようです。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/02/08(火) 10:59:39

>>89
入れてみましたけど

octave:1> backend("fltk")
error: `backend' undefined near line 1 column 1

となりますね。
plotするとgnuplotで描画されます。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/02/08(火) 12:32:24

>>91
graphics_toolkitに変わったみたいですよ（たしか）

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/02/08(火) 14:27:09

>>92
確認しました

octave:1> graphics_toolkit('fltk')
octave:2> xx=[0:100];
octave:3> yy=sin(xx./5);
octave:4> plot(xx,yy)

これで表示されました

**octave for windows メモの筆者** · 2011/02/09(水) 09:54:37

>>90
ckw のご指摘ありがとうございました。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/02/09(水) 10:00:50

Octave-3.4.0のソースがリリースされました。
http://www.gnu.org/software/octave/download.html

各ディストリビユーターによるバイナリのリリースはこれからだと思います。

なお，Windows版はMaintanerのBenjamin Lindnerさんの準備状況から
少し時間がかかると思います。
混乱を避けるため，3.4.0のtesting binaryを私の方から出すことは
しないつもりです。

直前のスナップショットの3.3.92を出すかもしれません。
（たぶん中身はほとんど変わらない）

**octave for windows メモの筆者** · 2011/02/10(木) 07:16:38

GUI Octave　なるものがあるそうです。

https://sites.google.com/site/guioctave/

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/02/10(木) 12:50:16

>>96
GNUplotを使ってたり残念感がありますね
ckwとgnuplotをwxt拡張で使ってる方がまだましというか
どうせならScilabやR言語のグラフ機能を乗っ取ったとかの方が良かった

**octave for windows メモの筆者** · 2011/02/27(日) 16:18:39.27

>>97
まあ，3.4になってfltkになればよくなると思いますが。Windowsでは，
まだしばらく3.4のリリースかかりそう。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/03/27(日) 03:29:38.85

3.4をビルドしてみたけど、fltkでついにui系の機能が実装され始めたみたいだね。
今のとこuigetfile、uiputfile、uigetdir、uimenuだけだけど、今まで手つかずだっただけに素晴らしい！

ところで、fltkって画像ファイルの出力ってできないんだろうか？
graphics_toolkit fltk;
plot(1:10);
print('test.eps','-deps');
とかやっても、空っぽのファイルしか出来ないんだけど…。
他の形式でも同様。

…うん、printはgnuplot backend使えって話はごもっともなんだけど、アニメーション作成用に
もうちょっと高速な出力手段を模索中。

誰か情報持ってない？

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/04/15(金) 10:51:34.50

すみません，2ch初心者なんですが…．
Octaveのプログラミングについて質問させていただける板ってどこにありますか？
「Octave」「octave」で検索かけてもこの板しか見つかりませんでした．
エラーの返ってきちゃう関数をどうすれば使えるか調べたいんですけど(汗)

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/04/18(月) 22:25:16.10

>>100
MATLABのスレを探してみてください
OctaveはMATLABのクローンなので

あと、エラーの返ってくる関数を調べる方法は知りませんが
エラー処理はtry, catch でやります

例

A=[1,2]
B=[1;2]
try
C=A+B
catch
%lasterr
disp('error!!')
D=A+B'
end

AとBはベクトルの向きが違うので、足すとエラーが出るのですが
エラーの出そうな処理をtryの後に書き、エラーが出た後の処理をcatchの後に書きます
コメントアウトしているlasterrは直前のエラーが何かを表示します

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/05/08(日) 12:20:29.28

octave for windowsはビルドが難航してるのかな？

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/13(月) 00:08:14.52

octave から gnuplot を使うとき、最近のバージョンのoctave だと
gset や __gnuplot_set とかが使えないんですが

set term tgif みたいな処理はoctave からはどのように
すれば良いんでしょうか？

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 03:40:35.38

>>103
最近バージョンでは，gnuplotのコマンドを直接たたくことはできません。

plotしたあと
drawnow のdebug オプションを使って
>> drawnow ("tgif", "foo.tgif", false, "debug.gp")
で
>> system('gnuplot debug.gp');
でfoo.tgifを作成する。
ぐらいでしょうか

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 03:56:40.97

>>104
すみません。やってみましたが，うまくいきませんでした。<m(__)m>

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 04:07:12.45

>>105
うまくいかなかったのはWindows 版のgnuplot のbug のせいのようです。
windowsでは
system('gnuplot debug.gp');
system ('type debug.gp | gnuplot')でうまくいきそうです。
tgifをもっていないのでfoo.tgifをテキストエディタで確認しただけですが。

postscriptでうまくいったので，tgifでもおそらくいくと思います。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 06:58:04.50

>>103 たびたびすみません。ケアレスミスがあるので104-106は無視してください。

plotしたあと
drawnow のdebug オプションを使って
>> drawnow ("tgif", "foo.obj", false, "debug.gp");

でgnuplotのスクリプトdebug.gpを出力し
それをsystemコマンドでgnuplotでgif出力（foo.obj）させます。
>> system('gnuplot debug.gp');

debug.gp　のデータはバイナリであり，windows 上ではgnuplotバクにより
正しくプロットされません。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 07:02:12.97

107の続き

windowsでは
>> system ('type debug.gp | gnuplot');
としてください。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/16(木) 07:33:34.95

108　の続き

tgif はもっていないので，fig ファイルを生成するようにして
Cygwin 上Xfigで
でfoo.figを作成したところうまくいきました。

　>> drawnow ("fig", "foo.fig", false, "debug.gp");
　>> system ('type debug.gp | gnuplot');
　できたfoo.fig をXfigでよみこんでプロットを確認しました。
tgifでもうまくいくと思います。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/18(土) 10:54:38.14

octave for windows メモの筆者さん
>>103です。
いろいろお答えいただきましてありがとうございました。

tgif への出力はできるようになりました。

私がoctaveを使いこなしていないからかも
知れませんが個人的には gnuplot の細かい設定が
octave上からできる方が便利なのですが。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/18(土) 17:08:46.76

>>110
Octave は3.2(3.2では試験的，3.4から本格的)から
Open GL ベースのグラフィックスを扱うようになり，
整合性の観点から低レベルでgnuplotを直接触ることはやめになりました。
その代わり，octave-forgeにgnuplot パッケージがあり，
gnuplotを直接いじりたい方はそちらを使うという思想のようです。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/18(土) 17:15:21.41

>>111 gnuplotとパッケージのReferenceはこちらから，
http://octave.sourceforge.net/gnuplot/overview.html

説明がわかりにくいのでつかったことはありません。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/18(土) 20:09:09.69

>>112
意外と良いかも

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/20(月) 11:49:46.70

cygwin x上で以下のようなエラーが出てgnuplotを使うことができません．どなたか解決策が分かる方いましたら教えて下さい．

octave:1> x = [0.0, 0.2, 0.4]
x =

0.00000 0.20000 0.40000

octave:2> plot(x, sin(x))
error: Invalid call to strcat. Correct usage is:

-- Function File: strcat (S1, S2, ...)

error: called from:
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/help/print_usage.m at line 87, column 5
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/strings/strcat.m at line 92, column 5
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/plot/__gnuplot_get_var__.m at line 113, column 11
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/plot/__go_draw_axes__.m at line 40, column 18
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/plot/__go_draw_figure__.m at line 167, column 19
error: /usr/share/octave/3.4.0/m/plot/__gnuplot_drawnow__.m at line 86, column 5

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/21(火) 00:54:07.79

>>114
どうもCygwin1.7.9-1とOctave+gnuplotの相性が悪いようで
Cygwin を1.7.8-1のダウングレードすると動きます。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/21(火) 15:01:05.47

114です．
cygwinのバージョンを1.7.8-1に直したところグラフ表示できました．ありがとうございました！！

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/21(火) 21:24:25.60

最近octaveを始めたんだけど
octaveのサポート状況の良いディストリってどれ？

ubuntu のoctave はバージョン古い。
FreeBSDのportsのoctaveなんかは最新のおっかけは凄いけど
portsからのインストールは遅い。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/22(水) 03:04:37.49

>>117
jweさんがDebianだからのぞいてみたけど，まだ3.2.4のままですね。
octaveの本家のMLをみるとLinuxの人は割りと自分でビルドしているようです。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/22(水) 06:18:06.49

>>117 >>118 Unix はよくわかりませんがぐぐったら以下がでてきました。
octave Download - Linux Packages Search (RPM, DEB, XZ, TXZ, TGZ)
http://pkgs.org/package/octave
3.4.0のようです。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/24(金) 03:56:24.07

FreeBSDでは、現在 3.4.1 です。
なんか凄い気合入って追っかけているような感じ。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/24(金) 04:04:41.54

>>120 FreeBSDのOctaveのメンテナーの方を知っています。
（日本人です。）
その方は多倍長BLASの作者でもあります。
最近連絡を取りました。

ところでoctave 3.4.1には，mkoctfileにバグが見つかり,
3.4.2の準備段階です。（現在RC2がでている）。
FreeBSDは，3.4.2がでたらすぐ対応するようです。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/24(金) 23:22:10.88

しばらくはFreeBSDだな。
Octave のためだけに。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/25(土) 00:23:16.92

VMwareにFreeBSD入れておくか

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/25(土) 01:55:02.93

octaveのメーリングリストを見ていると
MysqlでもCUDAでも何でも新機能を導入しようとする場合に
John W. Eaton氏が、GPLかどうかを問いかけて潰れていってる気がする

Rなんか2009年の段階でGPU対応してるのに
http://brainarray.mbni.med.umich.edu/Brainarray/Rgpgpu/
Mysqlにまで対応している
http://www.okada.jp.org/RWiki/?RMySQL

じゃあScilabでもいいやと調べてみても
まともなものが無い
Scilabは他のtoolboxも貧弱だし

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 02:16:04.98

ソースだけど3.4.2がでました。
http://octave.1599824.n4.nabble.com/GNU-Octave-3-4-2-Released-td3622778.html

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 02:33:11.93

>>124

MySQLはoctave-forgeで対応している気がする。
自分では使わないから詳細はわかりませんが。

http://octave.sourceforge.net/database/overview.html

These are bindings that allow SQL queries and other database operations
on postgres, mysql, sqlite, and standard ODBC databases from within
Octave. A simplified interface that is uniform across all database types
is provided, as well as the entire C client API for each database
(libpq, libmysqlclient, etc).

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 02:42:05.19

>>124 >>126
こんなページもあります。
http://octave-swig.sourceforge.net/octave-db.html

これを見る限りOctave-forgeのdatabase パッケージにてMySQLには
対応できるのではと思います。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 06:29:16.81

>>124
CUDAについては，OctaveはGPLですので，
jwe氏が言うことは仕方のないことなのでしょう。
OctaveがGPLから他のライセンスに変えるか,GPLが変わるか
CUDAがかわるかどちらかでないといけないのでしょうが，
まあ実現はしないのだと思います。

ところで，MySQLは，
http://www-jp.mysql.com/about/legal/licensing/faq.html
にあるように問題がないように思います。
だからOctave-forgeのdatabaseパッケージでMySQLはサポートされている
のだと思っています。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 06:35:35.07

>>128
ただし，再配布せず自分でやる分には問題がないと思います。
以前GotoBLASが，GPL非互換だったとき自分でソースからビルドして，
octaveのビルド時に組み込んで使用することはできました。

かなり，億劫なことになりますが，
http://scinesur.wordpress.com/2009/11/12/cuda-on-octave-3-x-in-linux-64-bits/
なこのページもあることですし，自力でやることはできるのかなと思います。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/06/25(土) 08:57:30.61

>>126
mingw版もcygwin版も(どちらも3.2.4)

octave:5> pkg install database-1.0.4.tar.gz

で入れようとしても、内部のmakeでこけますね

tar.gzを直接開いて./configureしてみると
sqlite3でwarningが出るし
結果がこれで

octave-forge is configured with
octave: octave (version 3.2.4)
mkoctfile: mkoctfile for Octave 4
swig: pre-generated
postgres: postgresql/libpq-fe.h not found
mysql: mysql/mysql.h not found
sqlite3: yes
odbc: yes

postgresqlやmysqlはライブラリが必要みたいだし
makeもsqliteの段階でこけるので、unix系なら動くのかもしれませんが
Windowsでは無理っぽいですね

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/25(土) 12:23:55.27

>>130

そうですね。3.0.xのころdatabaseパッケージを四苦八苦していれましたが，
postgres　と　mysqlはあきらめてsqlite3とodbcだけでやったことがあります。

CygwinならたしかpostgresqlがOctaveを意識せずにあったような気がしますが，
それを使ってpkg installをしたことがないので，なんともいえません。
Cygwinの方がUnixに近いのでライブラリをかき集めれば何とかなるかも
知れません。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/06/29(水) 02:59:55.51

MinGWの体験版のOctave-3.2.4バイナリを作成し，配布してます。
http://www.tatsuromatsuoka.com/octave/Eng/Win/

あくまでも体験版で，
Octave-forgeがはいっていませんし，バグもあると思います。
インストーラーなる気の利いたものもなく，zipファイルを解凍して
適当なフォルダにおきます。
ビルドに必要なツールも一応いれたつもりなので，自分でビルドしてみたい
方はどうぞ。ただし，あまり丁寧な説明はしていません。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/07/04(月) 06:29:50.28

どなたか賢い方、助けて下さい…

Benjaminさんの
Octave-3.2.4_i686-pc-mingw32_gcc-4.4.0_setup.exe
で、コマンドラインからのpath指定が効かないんですが、なんとかなりませんでしょうか？

> octave.exe --path c:\
> octave.exe --path c:\\
> octave.exe --path c:/
> octave.exe --path c://
> octave.exe --path /c/

いずれもダメでした。
Linuxなら特に問題ないのですが…

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/04(月) 15:21:59.89

>>133 Cygwin版ならちゃんと動くんでバグかもしれません。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/04(月) 15:28:18.58

>>133

>octave --eval "cd c:\\" --persist
で代用できませんか？

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/04(月) 15:38:46.46

>>134, 135　すみません勘違いです。

マニュアルによれば
--path path
-p path
Add path to the head of the search path for function files.
The value of path specified on the command line will override any
value of OCTAVE_PATH found in the environment, but not any commands in
the system or user startup files that set the internal load path
through one of the path functions.

となっていて，Cygwin版でもMinGW版でも OCTAVE_PATH には，なにも反映され
ない。Linuxでの期待通りの動きとはどんなものですか？

Linuxもってないのでわからないので。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/07/04(月) 23:18:23.00

>>134-136
試して下さって、大変ありがとうございます！！

Linux版なら、
$ octave -q --path /home/user/work
octave:1> path
.
/home/user/work　（←このフォルダが存在する場合のみ）
/usr/lib/octave/3.2.4/site/oct/i686-pc-linux-gnu
/usr/lib/octave/site/oct/api-v37/i686-pc-linux-gnu
...
となります（恐らくご想像通りでしょうが…）。

ちなみに、
$ OCTAVE_PATH=/home/user/work octave -q
でも同義です。

こちらでも迂回策を探してはいるのですが、環境変数も効きませんし、なかなか…

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 01:47:59.89

>>137
octave --eval "addpath C:\\" --persist
ではいかがでしょうか。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 01:56:50.28

>>137 蛇足です。Cygwin版のoctaveでは，おっしゃられている動作をする
ようです。MinGWならではのバグのようです。

職場のパソコンで自分でビルドした3.4.2（MinGW）でも，動作しなければバグ
報告をします。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 06:45:34.07

>>139 職場のパソコンでoctave 3.4.2と3.2.4(Benjamin版)で試してみました。

octave --path c:\
＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊
3.2.4
.
C:\Programs\Octave\3.2.4_gcc-4.4.0\share\octave\packages\zenity-0.5.7
　（以下略）
＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊
3.4.2
.
C:
C:\octave\3.4.2\lib\octave\3.4.2\site\oct\i686-pc-mingw32
:
(以下略)
となるのですが
octave --path C:\octave

Octave's search path contains the following directories:

.
C:\octave
C:\octave\3.4.2\lib\octave\3.4.2\site\oct\i686-pc-mingw32
:
　（以下略）
＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/07/05(火) 07:58:49.52

>>138
ありがとうございます、現在そちらの方向で検討中です。

>>140
え？なぜ3.4.2はそんな残念な動作に…
3.2.4（Benjamin版）ではC:\Octaveを指定しても駄目なようですね

こちらの職場PCにはBenjaminさんのメモにしたがってビルドした
3.2.4がありますので、そちらも試してみます。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 08:11:41.89

>>141
140　は長くて，2chにおこられたので，後から続きを書こうとしてわすれていました。
どーもドライブのルートディレクトリの場合は失敗して，C:\とならず，C:
となるのですが，C:\octaveのような場合は大丈夫です。

一応，development branch　でも試すために，現在ビルド中です。　

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 09:51:31.50

>>142 予想通りDevelopment Branchのソースからビルドしても，
octave --path c:\
のようなルートディレクトリの指定はバグってますね。
時間があるときにbug trackerに登録します。
（直るかどうかわかりませんが。）

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/05(火) 10:18:47.77

>>143 bug tracker に登録しておきました。
https://savannah.gnu.org/bugs/?33714

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/07/05(火) 23:05:49.70

>>143
大変感謝です…。

ちなみに、Benjaminさんメモに従ってビルドした3.2.4ですが、
MSYS環境ではpath指定が通りました。

コマンドプロンプトからはlibgcc_s….dllが足りないとか言われて
実行できなかったので、未検証です。
（MSYS環境以下を探しても見つからなかったので諦めてましたが、
よく考えたらMinGW環境以下にありそうですね…忘れてました）

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/06(水) 01:46:53.64

>>145
Msys 環境下で指定がうまくいくということは，パスのハンドリングが
octave --path でUnix likeになっているからかもしれません。
なお，libgcc_s….dllなどたらない，dllは，Benjaminさんのビルドのbin
ディレクトリからコピーして，自分でビルドしたoctave.exe,
octave-3.2.4.exeのあるディレクトリにペーストすればいいです。

または，バッチファイルなどでBenjaminさんのビルドのbinディレクトリに
パスを通すという手もあります。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/07/06(水) 18:47:15.59

>>146
コマンドプロンプト環境下で試してみました。
dllはOctaveのビルドに使用したc:\mingwのbinにパスを通して
対処してます。

octave --path c:\msys -> OK
octave --path c:\ -> OK（ちゃんとc:\と表示される）
…あれ？

Benjaminさんメモに従うとコンパイルは自動で流れるので、
できるバイナリはインストーラで配布されているものと
同じはず、だと思うんですが…？

なお、本来の目的はOctave起動後にaddpathすることで達して
おりますので、これ以上追いかける意味は無くなってしまったのですが…。
ご報告まで。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/07/06(水) 21:34:11.72

>>147
ご報告ありがとうございました。
回避法があるとはいえ，不思議ですね。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/08/03(水) 16:34:09.93

質問いいでしょうか？
画像をfft2して、その後、元の画像に戻るかiff2でチェックしたいのですが、どうもうまくいきません・・・
プログラムのどこが悪いのでしょうか？

Iin=imread('BOAT.bmp');% 画像の入力
figure,imagesc(Iin,[0 255]);% 画像表示
colormap(gray);
axis image;

%FFT変換
Iin_d=double(Iin);
O_fft=fft2(Iin_d);% FFT
O_fft=fftshift(O_fft);
O_fft=(abs(O_fft));
O_fft=10*log10(O_fft);% FFT結果のlog表示
figure,imagesc(O_fft,[0 MAX]);% 画像表示
colormap(gray);
axis image;

%逆FFT
O_fft2=(abs(O_fft2));
O_fft2=10*log10(O_fft2);
O_fft2=fftshift(O_fft);
O_fft2=real(ifft2(O_fft2));
figure,imagesc(O_fft2,[0 MAX]);% 画像表示
colormap(gray);
axis image;

どなたかお願いします

**octave for windows メモの筆者** · 2011/08/08(月) 09:37:41.35

>>149
画像処理は詳しくありませんが，演算が逆演算になっていないような気がします。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/08/08(月) 14:03:14.87

abs()をつけてる時点で虚数次元が飛んでますからね

**octave for windows メモの筆者** · 2011/08/08(月) 16:59:04.63

>>149 >>150
自信なし：一応画像で確認した。

Iin_d=double(Iin);
O_fft=fft2(Iin_d);% FFT
O_fft2=real(ifft2(O_fft)); %ifft
figure,imagesc(Iin,[0 255]);

fftした結果を演算されていますが，もとのイメージのフーリエ空間での
画像に演算をされておられるので情報が変わってしまっています。
したがって，ifftで戻るはずは原理的にないような気がします

**octave for windows メモの筆者** · 2011/08/08(月) 17:55:52.63

>>152
訂正

Iin_d=double(Iin);
O_fft=fft2(Iin_d);% FFT
O_fft2=real(ifft2(O_fft)); %ifft
figure,imagesc(O_fft2,[0 255]); %ここを訂正

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/08/09(火) 15:43:46.03

むしろこんな感じ

sigma=40;
for XX=1:128,
for YY=1:128;
ZZ(XX,YY)=63*exp(-1*(XX-64)^2/(2*sigma^2))*exp(-1*(YY-64)^2/(2*sigma^2));
end;
end;
ZZ1=fft(ZZ);
ZZ2=ifft(ZZ1);
image(ZZ)
colorbar
pause(2);
image(abs(ZZ1))
colorbar
pause(2);
image(abs(ZZ2));
colorbar
pause(2);

要点は、imageで表示するとき以外はabsとかを使わない

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/02(金) 10:37:46.27

Blas としてOpenBLASかなり使えます。
https://github.com/xianyi/OpenBLAS

なお，Cygwin 上にmingw64のクロスコンパイラが入りました。
mingw64は32 bitもサポートしていますので，windows 用には，
それを使います。
（setup.exeでインストールしてください。）

makeは以下のようにしてください。
make CC=i686-pc-mingw32-gcc FC=i686-pc-mingw32-gfortran OSNAME=WINNT TARGET=CORE2
TARGETは各自のCPUにあわせてください。
できた
libopenblas_(cpu id)-r0.1alpha2.2.dll
octaveのあるbinフォルダにコピペして，
octave-3.2.4 mingwなら blas.dllとリネームすればいいです。
（octave-3.4.2 ならlibblas.dllに）

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/05(月) 10:46:31.60

Octave-3.4.2-mingw + octaveforge pkgs が出ました。
http://old.nabble.com/Octave-3.4.2-mingw-%2B-octaveforge-pkgs-to32394771.html

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/07(水) 17:24:14.86

Gnu Octave windows版のOctave-forge packageがアップデートされました。
http://old.nabble.com/Re%3A-Octave-3.4.2-mingw-%2B-octaveforge-pkgs-p32413743.html

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/15(木) 08:01:26.94

Gnu Octave windows版のOctave-forge packageがアップデートされました。
http://octave.1599824.n4.nabble.com/Updated-Octave3-4-2-Mingw-for-testing-was-Mingw-Octave-3-4-2-blank-gnuplot-printouts-td3814047.html

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/09/22(木) 00:01:20.14

memory exhaustエラーが、少し大きめのデータで出てしまうのが、
改善されるといいなぁ。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/09/22(木) 09:47:51.52

>>159
64bit版ならそのエラーが簡単には出ないって話ですけどね
ただし正式なバイナリーがリリースされてない

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/22(木) 14:14:55.62

>>159 >>160

ttp://www.gnu.org/software/octave/doc/interpreter/Compiling-Octave-with-64_002dbit-Indexing.html

にしたがってビルドするしかないようですね。
Debian 上での例が載ってます。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/22(木) 17:00:01.71

>>159 >>160
Scilab なら64bit版があるようです。

ttp://www.scilab.org/products/scilab/download

でも，文法かなり違うからなあ。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/09/26(月) 13:34:26.79

>>162
Scilabの32bitも64bitもメモリー管理としては大差無いようです

Windows7 64bit に4GBのメモリーを積んだ条件で
Octave 3.2.4で

AA=ones(12000,10000);

とやると通りますが

AA=ones(13000,10000);

では error: memory exhausted と出ます。

Scilab 5.3.3 では32bitでも64bitでも

stacksize('max');

を実行した後に

AA=ones(13000,10000);

は通りますが

AA=ones(14000,10000);

はエラーが出ます。
倍精度が16bitだとして(複素数の実部と虚部にそれぞれ8bit倍精度)
2GBぐらいに壁があるようです。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/26(月) 17:59:23.61

>>163
私もやってみました。
-->AA=ones(13600,10000);
!--error 17
stack size exceeded!

Use stacksize function to increase it.
Memory used for variables: 135007946
中間的なメモリが必要です: 136000002
Total memory available: 268435455

Scilabの場合，スタックサイズの上限に問題があるようですね。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/09/27(火) 09:00:38.67

>>163
倍精度複素数16bitではなくて16Bytesの間違いでした

全部の変数で2GB未満しかアロケート出来ないっぽいです
2^32は42億9496万7296でしたか、つまり4Gですが
CPUは2の補数をとった2Gまでしかアクセスできないのでしょう

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/27(火) 10:26:32.43

>>165
ttp://www.gnu.org/software/octave/doc/interpreter/Compiling-Octave-with-64_002dbit-Indexing.html
をよく読むとArray Indexとなる整数のバイト数を64 bitの体系にあわせて，
ライブラリまで含めて構築しなおす必要があるようです。
（たとえばFortran のライブラリなら（たとえばLAPACK），
interger のデフォルトのバイトを8バイトにする。）
Scilab 64 bitは，そこまで考えてビルドされていなのではと推測します。

**octave for windows メモの筆者** · 2011/09/30(金) 10:42:53.78

Octave 3.4.3-rc0 release candidate available for ftp

ttp://octave.1599824.n4.nabble.com/Octave-3-4-3-rc0-release-candidate-available-for-ftp-td3857294.html

だそうです。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/10/01(土) 22:47:50.57

Octaveの連想配列はどう書けば良いのですか?
データに番号がついていて連続していない状態で、他のデータから連続していないデータを参照しているので
内部で番号をつけ直しています。つけ直しの時に総ナメのような感じになってしまうので連想配列が使えたら
と思いまして質問しました。

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/10/02(日) 01:13:05.09

>>168
構造体で、それっぽいことはできたはず。
その用途でしたら、スパース行列でもよさげ。
どっちが速いかは未検討。

**168** · 2011/10/02(日) 09:20:50.75

>>169
a.idみたいな感じで丁度構造体を使っているので構造体を使った連想っぽい処理をもう少し具体的に知りたいです
どんな感じで使えば良いのですか?

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/10/02(日) 14:17:52.86

>>169
問題がややあいまいなので、もうちっと具体的にどうぞ。
情報の後出しは、無しということで。

**168** · 2011/10/02(日) 18:24:07.84

どこまで必要な情報なのか・・・書ききれるのか分かりませんが書いてみます
有限要素法のプログラムを勉強のために作っているのですが、データが節点、
要素等番号がついています。NASTRANのデータ形式をGRIDとかCHEXAとか
を使っています。(手を抜いて継続行を一行にしていたりしますが・・・)
これらの番号(ID)は連続した数字ではなく、プログラム内部で参照して番号を
関連付けるしかないのですが、現状総ナメで番号(ID)を内部の連続した配列番号
に関連付けています。変数はelem(:).id、node(:).idがデータの番号で関連付
けした変数はelem(:).no、node(:).noとかにしています。主にelemがnode
を参照するのでnode(:).idを連想配列風の処理で内部の配列番号に変換したいのです
読みにくいと思いますが、構造体を使った連想配列風の処理を教えていただけない
でしょうか？

**名無しさん＠お腹いっぱい。** · 2011/10/02(日) 23:48:46.22

>>172
もっとスマートな方法もありそうですが…
期待外れだったら、すいません。

案１（スパース行列）
node_id = [1 10 100 1000 10000];
node_id_t = sparse(0,0);
node_id_t(node_id) = 1:length(node_id);
% node_id_t(10000) -> 5

案2（連想配列？）
node.id_1 = 1;
node.id_10 = 2;
node.id_100 = 3;
node.id_1000 = 4;
node.id_10000 = 5;
% getfield(node,['id_' num2str(10000)]) -> 5

ちなみに、FEMをOctaveで、ということでしたら、OpenFEMというのも参考になるかもしれません。
Matlab用で、コードがめちゃくちゃ読みづらくて、かなりbuggyで信用なりませんが、
各種アルゴリズムの実装を知るには非常に有用です（個人的に、固有値解析のとこは感動しました）。

**168** · 2011/10/04(火) 20:03:02.40

>>173
お返事有り難う御座います。
処理速度を早くするためにはスパース行列が良さそうですね、
処理手順を多少弄らなければいけなさそうですが少し考えてみます。
案2の方も少し考えてみます。（使えそうな使えなさそうな・・・）

OpenFEMの情報有り難う御座います。少しググってみます。