初心者です。

ファイル名が、
年月日.種類.年日.場所.更新日時.拡張子
となっているファイルを扱っています。
年月日および年日（対応してます）は全部でおよそ400、場所は200〜300あり、
5種類分あるので、各種類約10万ファイル、全部で50万ファイルくらいあります。
この中から、年月日.種類.年日.場所.*.拡張子だけ同じで、
更新日時が違う複数のファイルを見つけ出し、古いファイルを消さねばなりません。

例を示すと
./2001.08.29/MOD15A2.A2001241.h15v03.005.2007052031007.hdf
./2001.09.06/MOD15A2.A2001249.h15v03.005.2007054111501.hdf
./2001.09.06/MOD15A2.A2001249.h15v03.005.2008278130254.hdf
./2001.09.14/MOD15A2.A2001257.h15v03.005.2007056161438.hdf
こんな感じです。この場合、２番目のファイルだけを消したいです。

ファイル名が完全一致の重複ではないだけに、どうしていいかわかりません。
できればお教えください。

ちなみにディレクトリ構造は、種類-年月日-ファイル、となっています。