>これは正常なのでしょうか?

ちと遅いかな。

>あとコンソールからstartxと打った場合とxdmからログインした場合の初期化の挙動が違うのですが、
>どのようにすればstartxと同じ初期化をすることが出来るのでしょうか?

.xinitrc だの .xsession だの .xstartup だので同じように設定すればいい。