マシンをリブートする場合って、誰かがログインしている場合は、ログアウトしてもらうようにお願いしてもいいのでしょうか？

ログインしている誰かのファイルが壊れるのはどうでもいいのですが、
システムが壊れることがあるかどうかという視点で回答お願いいたします。